Pourquoi certains dorment très bien après un espresso : l'histoire de CYP1A2

Le café tient certains éveillés douze heures et n'affecte presque pas les autres. La différence est en grande partie inscrite dans deux gènes. Ce que montre réellement la génétique de la consommation de café, et comment lire la vôtre.

Dans les cafés londoniens du XVIIᵉ siècle, un penny donnait droit à une tasse et à une place assise, et les habitués refaisaient le monde jusqu'à ce que les chandelles s'éteignent. Certains rentraient chez eux et dormaient parfaitement. D'autres restaient éveillés à rédiger des pamphlets. Aucun ne savait que la différence tenait en partie à leur foie.

Les « universités à un penny ». Trois siècles avant que quiconque puisse nommer CYP1A2.

L'enzyme qui fait le gros du travail

Environ 95 % de la caféine que vous buvez est dégradée par une seule enzyme, le cytochrome P450 1A2, codé par le gène CYP1A2. La vitesse à laquelle cette enzyme travaille varie sensiblement d'une personne à l'autre, et un variant fréquent du gène, rs762551, suit cette différence. Les porteurs du génotype A/A sont généralement décrits comme métaboliseurs rapides ; les porteurs d'un allèle C éliminent la caféine plus lentement.

La portée clinique de cette différence est apparue dans une étude cas-témoins sur l'infarctus du myocarde menée au Costa Rica. Chez les métaboliseurs lents, une consommation de café plus élevée était associée à un risque accru d'infarctus non fatal, alors que chez les métaboliseurs rapides la même consommation ne montrait pas cette association — et, à dose modérée, apparaissait inversement associée (Cornelis et al., JAMA, 2006, PMID : 16522833). Autrement dit, la dose qui compte dépend de l'enzyme qui la lit.

Une réserve à énoncer clairement : il s'agit d'une seule population observationnelle, et cette interaction n'a pas été répliquée de manière uniforme. Elle décrit une association au sein d'un groupe, pas un verdict sur un individu.

Ce qu'a apporté l'analyse pangénomique

Le tableau d'ensemble vient d'une méta-analyse d'études d'association pangénomique portant sur plus de 90 000 buveurs de café d'ascendance européenne et afro-américaine. Elle a confirmé les deux signaux établis près d'AHR (rs4410790) et de CYP1A2 (rs2472297) et identifié six loci supplémentaires — dont POR et ABCG2, tous deux plausiblement impliqués dans le métabolisme de la caféine, ainsi que GCKR, MLXIPL, BDNF et SLC6A4, plus proches de la biologie métabolique et de la récompense (Cornelis et al., Molecular Psychiatry, 2015, PMID : 25288136).

L'interprétation retenue par les auteurs mérite d'être gardée en tête. Ces variants ne codent pas un goût pour le café. Ils semblent déterminer la quantité de caféine nécessaire pour atteindre l'effet recherché, et la durée pendant laquelle le prix de cette tasse reste dans l'organisme. Chacun ajuste sa propre dose, le plus souvent sans le savoir.

Deux personnes, un espresso, deux après-midis très différents.

Les tailles d'effet, honnêtement

Chacun de ces variants déplace la consommation habituelle d'une fraction de tasse par jour. Ensemble, les loci connus n'expliquent qu'une faible part des différences entre individus. La dette de sommeil, la tolérance, la grossesse, le tabac et certains médicaments modifient eux aussi l'élimination de la caféine — le tabac, en particulier, induit fortement CYP1A2. Votre génotype est un facteur parmi d'autres, et ce n'est pas le plus important tous les jours de votre vie.

Il s'agit d'une prédisposition génétique, pas d'un diagnostic. Rien ici ne justifie de modifier un traitement, et si vous avez des antécédents cardiaques, cette conversation revient à votre médecin plutôt qu'à un billet de blog.

Lire la vôtre

L'application Coffee Metabolism applique les résultats de Cornelis et de ses collègues à votre génotype et indique où vous vous situez sur le spectre des métaboliseurs, variant par variant, en citant l'étude source — c'est-à-dire la position qui aurait été la vôtre parmi les participants de ces travaux si vous y aviez pris part.

Elle ne vous dira pas s'il faut prendre la deuxième tasse. Elle vous dira, avec une confiance raisonnable, combien de temps cette tasse compte rester.